מבנה האטום, סוגי קשרים, אורביטולות מבנה מרחבי של מולקולות, חומצות ובסיסים. נומנקלטורה ותכונות פיסיקליות של פחמימנים רוויים (Alkanes) ונגזרותיהם מבנה תלת ממדי של פחמימנים רוויים ושל ציקלואלקאני. מבנה תלת ממדי של ציקלוהקסן, ציקלוהקסן מונו מותמר, די מותמר וטבעות דחוסות. ראקציות של פחמימנים רוויית. ראקצית שרשרת רדיקלית. סטריאוכימיה. קונפיגורציה וקונפורמציה, אננטיומרים ודיאסטריאומרים, פעילות אופטית, כיראליות, היטלי טריז, פישר וניומן ומעבר ביניהם. מולקולות בעלות שני מרכזים קיראליים ויותר, אלקיל הלידים, נומנקלטורה, תגובות התמרה של אלקיל הלידים (SN1 SN2,) קרבוקטיונים ויציבותם היחסית, שחלופים, אלקנים (Alkenes) הקשר הכפול, נומנקלטורה, איזומריית ציס-טרנס, תגובות סיפוח לאלקנים, תגובות אלימינציה (E1 ו-E2) התמרה לעומת אלימינציה, דיאנים, סיפוח לדיאנים 1,2 לעומת 1,4. ראקציות של כהלים, תיולים אפוקסידים ואתרים, רזוננס וארומטיות, בנזן ונגזרותיו, התמרה אלקטרופילית ארומטית. הכוונה ע"י מתמיר קיים, הקבוצה הקרבונילית - אלדהידים וקטונים: חמצון-חיזור בתרכובות אורגניות, סיפוח נוקלאופילי, טאוטומריית קטו-אנול, חומציות מימני אלפא וריאקציות בעמדה אלפא, דחיסה אלדולית, חומצות קרבוקסיליות ונגזרותיהן: הגורמים לחוזק חומציות, התמרה נוקלאופילית אצילית, אציל הלידים, אנהידרידים, אסטרים ואמידים, סוכרים- קונפיגורציות ונומנקלטורה של סוכרים, תכונות של סוכרים, איזומריה בסוכרים, מונו סוכרים די-סוכרים ופולי-סוכרים, חומצות אמינו, פפטידים וחלבונים : שמותיהן ותכונותיהן של חומצות האמינו, הקשר הפפטידי, זוויות פיתול, סינתזת פפטידים, מבנים שניוניים ושלישוניים של חלבונים, כימיה אורגנית של תרופות .
דרישות הקדם והדרישות המקבילות בקורס כימיה אורגנית הינן:
דרישות קדם: מבוא לכימיה (50003)
דרישות מקבילות: אין
